La paridad de género divide a los consejeros del IEEBC, la mitad de ellos se pronunciaba por hacer historia cambiando una diputación por representación proporcional (RP) del hombre por una mujer, para que así la XXIII Legislatura estuviera conformada por mayoría femenina, pero al final no lo lograron. Después de una sesión extraordinaria fallida, dos rondas de votación y con el voto de calidad de la presidenta en funciones, el Consejo General del Instituto Estatal Electoral (IEE) declaró la validez del cómputo, la validez de la elección y entregó las constancias de las ocho diputaciones por RP, siendo éstas cinco para hombres y tres para mujeres.
La inconformidad vino debido a que si bien la coalición Juntos Haremos Historia por Baja California (Morena-PVEM-PTTransformemos) ganó las diputaciones de los 17 distritos del Estado, postulando nueve mujeres y ocho varones, en el cómputo final la balanza se inclina al género masculino, sumando trece hombres y doce mujeres. La ausencia del consejero presidente Clemente Custodio Ramos Mendoza complicó la situación debido a que se encontraba convaleciente de una operación del apéndice, lo que empató los cartones entre quienes querían el cambio de diputado y quienes querían que las cosas quedaran
